Die Online Apotheke vertreibt ihre Artikel ausschließlich über das Internet. Ihr Produktsortiment ist in der Regel genauso umfassend wie das einer stationären Apotheke. Aufgrund der schlankeren Betriebsstruktur (weniger Personal, kein Ladenlokal) kann die Online Apotheke deutlich günstigere Preise anbieten. Rabatte bis zu 50% gegenüber der unverbindlichen Preisempfehlung der Hersteller sind in der Online Apotheke keine Seltenheit. Zur Bestellung muss sich der Kunde im Shop der Online Apotheke registrieren und einloggen. Durch Eingabe von Namen oder Pharmazentralnummer des Medikaments in eine entsprechende Suchmaske wird man direkt zum gesuchten Produkt geführt. Ab einem bestimmten Mindestbestellwert entfallen in der Online Apotheke die Versandkosten. Der Einkauf in der Online Apotheke lohnt sich besonders für chronische kranke Patienten, die ihren Medikamentenbedarf im Voraus planen können.